Negi Springfield, seorang penyihir berusia 10 tahun, bercita-cita untuk akhirnya menjadi "Magister Magi", penyihir tertentu yang, dengan alasan untuk beroperasi di bawah NGO, menggunakan kuasanya untuk membantu individu biasa. Setelah lulus dari Merdiana Magic Academy di Wales, dia dapat diberi tugas mengajar bahasa Inggeris di sekolah menengah, di mana kursus wali kelasnya terdiri daripada 31 anak perempuan, masing-masing sangat sesuai dengan akademi Mahora sendiri. Acara ini memperincikan pengalaman dan masanya di Jepun ketika dia membantu mereka dalam masalah mereka, mendapat persetujuan dan rasa hormat dari murid-muridnya, dan menghadapi bahaya sihir dari dalam dan juga di luar Mahora Academy. Hubungan utama Negi adalah dengan Asuna Kagurazaka, rakan sebilik dan muridnya, yang pada awalnya tidak menyukai dia tetapi setelah mengenalinya sebagai kawan dan menjadi temannya walaupun semua wanita mempunyai kisah dan perwatakannya sendiri. Dia juga memburu ayahnya yang disebut sebagai Thousand Master.
Walaupun pada mulanya seolah-olah menjadi karya komedi romantik yang menampilkan banyak watak bisho jo seperti Love Hina, rancangan itu, telah berkembang menjadi campuran romantik, fantasi, seram, aksi dan komedi. Akamatsu mengatakan bahawa dia sangat ingin melakukan sesuatu yang "berbeza" dari Love Hina. Negi sendiri sudah dewasa, dan beberapa adegan dengan Asuna adalah variasi unik dari tren "adegan romantis yang canggung" dari harem manga, segera dihidupkan dan hanya tertawa. Selain itu, sebilangan besar gadis tidak dapat menipu dirinya dalam erti kata keanak-anakan tanpa harapan yang intim dalam pembaca [kajian yang unik?]
Dalam mengekalkan fesyen ini, Negi sendiri dianggap sebagai manga utama lelaki biasa dan juga perbandingan dengan Love Hina's Keitaro Urashima. Dia rajin, cekap, dan diperlakukan dengan baik, tetapi kerana penampilan dan usianya (jauh di bawah majoriti muridnya), dia merasa sangat tidak mengancam dan sukar untuk dianggap serius sebagai seorang guru; beberapa muridnya mengendalikannya sebagai anak kecil yang licik, jika bukan rakan sepermainan (atau permainan)
