Ringkasan
Dua bab pertama dari manga ini berfungsi sebagai pengantar dan menunjukkan kepada kita Godzilla yang merosakkan Tokyo pada tahun 1991. Dia akan segera disertai oleh Raja Ghidorah dan kedua-duanya bertengkar. Bab seterusnya menunjukkan sepasukan saintis dan penemuan sel bermutasi Godzilla. Dalam bab-bab berikut kita melihat Godzilla menghancurkan kota, dan Futurians tampaknya mengusulkan rencana untuk menyingkirkan manusia dari Godzilla. Mereka cepat mengungkapkan identiti sebenar mereka sebagai Xiliens yang menyamar yang ingin menakluki dunia dengan Raja Ghidorah. Naga itu mula terbang menuju Bumi, tetapi berhadapan dengan Biollante yang kini tinggal di serpihan angkasa. Semasa pertempuran, Raja Ghidorah menyerang Biollante dengan pancaran graviti. Biollante menyerap intipati kekuatannya dan kemudian menjadi klon King Ghidorah seperti tumbuhan. Tetapi walaupun dengan peningkatan Biollante, ia masih kalah. Piring Futurians musnah dan rancangan mereka gagal memaksa mereka untuk hidup dalam keadaan penyamaran di kalangan manusia. Bab seterusnya dikhaskan untuk sekumpulan nelayan yang berlayar dengan damai dengan menceritakan kisah Yamata no Orochi, sehingga Godzilla muncul di hadapan mereka. Orochi muncul dan bertempur dengan Godzilla. Ingin melihat raksasa, salah seorang pelaut mula menuju ke arah mereka. Tetapi, dia terlalu dekat dengan pinggir kapal dan pengsan menyebabkan dia jatuh ke dalam air. Ketika dia bangun, pertarungan selesai dan dia dan rakan-rakannya mendapati mereka karam di rakit. Bab-bab berikut adalah petualangan lucu dan menunjukkan kepada kita "di belakang tabir" dengan seorang stuntman yang dilahirkan dan dibesarkan untuk mewujudkan Godzilla di layar. Bab terakhir memaparkan Godzilla kecil yang ditangkap oleh tentera Tentera Laut AS yang ingin membawanya pulang, tetapi Godzilla dewasa muncul dan mengurangkan kapal mereka menjadi hancur.